全国１０００店に配本しているため、それ以外にＦａｘＤＭしたい。

はい、可能です。マイクロソフトのエクセルやテキスト形式で「電話番号」や「Fax番号」をお預かりして、そのデータにある書店に送信をするといった形が可能です。これは、データで電話番号やFax番号と重複するものは除くといった方法です。つまり、フィルターをかけるといった抽出です。