出版社で営業している書店を除いてＦａｘＤＭして欲しい。

はい、可能です。マイクロソフトのエクセルやテキスト形式で「電話番号」や「Fax番号」をお預かりして、そのデータを除く書店に送信をするといったことが可能です。

具体的には、あなたの書店リストと弊社の書店名簿を電話番号かFax番号の基準でマッティングをかけ重複していないものに対して送るといったことです。つまり、フィルターをかけて保有していない書店に送るといった抽出方法です。